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@MASTERSTHESIS{Mller:837421,
      author       = {Müller, Andreas},
      title        = {{I}mplementierung und {P}arallelisierung einer
                      3{D}-{S}trukturtensoranalyse auf {PLI}-{B}ildern},
      school       = {FH Aachen Campus Jülich},
      type         = {MS},
      reportid     = {FZJ-2017-06346},
      pages        = {87 p.},
      year         = {2017},
      note         = {FH Aachen Campus Jülich, Masterarbeit, 2017},
      abstract     = {Um den Verlauf von Nervenfasern im menschlichen Gehirn
                      nachvollziehen zu können, wurde am Institut für
                      Neurowissenschaften und Medizin des Forschungszentrum
                      Jülich die Methode Polarized Light Imaging, kurz PLI,
                      entwickelt. Dabei wird ein Gehirn post mortem in 60 μm
                      dünne Scheiben (ca. 2000 pro Gehirn) geschnitten und durch
                      ein Mikroskop aufgenommen. Um die zur Faserdarstellung
                      benötigte Auflösung zu erreichen, werden die Schnitte
                      jeweils kachelweise aufgenommen. Die so erzeugten Daten
                      werden vom PLI-Rekonstruktionsworkflow dreidimensional
                      rekonstruiert. Hierbei werden unter anderem die beiden
                      Raumwinkel der Fasern bestimmt. In weiteren Schritten werden
                      eine Maske zur Trennung von Hirn und Hintergrund berechnet
                      und die Kacheln zu einem Gesamtschnitt zusammengefügt.
                      Danach werden die einzelnen Schnitte registriert, d.h.
                      strukturell passend übereinandergelegt. Die Raumwinkel
                      dieser 3D-Karte, dem Volumen, konnten bisher nicht
                      verifiziert werden. Dazu wird in dieser Arbeit eine
                      3D-Strukturtensoranalyse entwickelt und auf die Daten
                      angewandt. Ziel der Arbeit ist ein Vergleich der Raumwinkel
                      des PLI-Rekonstruktionsworkflows mit den Ergebnissen der
                      3D-Strukturtensoranalyse. Darüber hinaus wurde das zur
                      Berechnung implementierte Programm parallelisiert, um den
                      Zeitaufwand der Berechnungen signifikant zu senken.},
      cin          = {JSC / INM-1},
      cid          = {I:(DE-Juel1)JSC-20090406 / I:(DE-Juel1)INM-1-20090406},
      pnm          = {511 - Computational Science and Mathematical Methods
                      (POF3-511)},
      pid          = {G:(DE-HGF)POF3-511},
      typ          = {PUB:(DE-HGF)19},
      url          = {https://juser.fz-juelich.de/record/837421},
}