Journal Article

FZJ-2016-05062

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Genome-wide association analyses identify new risk variants and the genetic architecture of amyotrophic lateral sclerosis.

van Rheenen, W. ; Shatunov, A. ; Dekker, A. M. ; McLaughlin, R. L. ; Diekstra, F. P. ; Pulit, S. L. ; van der Spek, R. A. A. ; Võsa, U. ; de Jong, S. ; Robinson, M. R. ; Yang, J. ; Fogh, I. ; van Doormaal, P. T. ; Tazelaar, G. H. P. ; Koppers, M. ; Blokhuis, A. M. ; Sproviero, W. ; Jones, A. R. ; Kenna, K. P. ; van Eijk, K. R. ; Harschnitz, O. ; Schellevis, R. D. ; Brands, W. J. ; Medic, J. ; Menelaou, A. ; Vajda, A. ; Ticozzi, N. ; Lin, K. ; Rogelj, B. ; Vrabec, K. ; Ravnik-Glavač, M. ; Koritnik, B. ; Zidar, J. ; Leonardis, L. ; Grošelj, L. D. ; Millecamps, S. ; Salachas, F. ; Meininger, V. ; de Carvalho, M. ; Pinto, S. ; Mora, J. S. ; Rojas-García, R. ; Polak, M. ; Chandran, S. ; Colville, S. ; Swingler, R. ; Morrison, K. E. ; Shaw, P. J. ; Hardy, J. ; Orrell, R. W. ; Pittman, A. ; Sidle, K. ; Fratta, P. ; Malaspina, A. ; Topp, S. ; Petri, S. ; Abdulla, S. ; Drepper, C. ; Sendtner, M. ; Meyer, T. ; Ophoff, R. A. ; Staats, K. A. ; Wiedau-Pazos, M. ; Lomen-Hoerth, C. ; Van Deerlin, V. M. ; Trojanowski, J. Q. ; Elman, L. ; McCluskey, L. ; Basak, A. N. ; Tunca, C. ; Hamzeiy, H. ; Parman, Y. ; Meitinger, T. ; Lichtner, P. ; Radivojkov-Blagojevic, M. ; Andres, C. R. ; Maurel, C. ; Bensimon, G. ; Landwehrmeyer, B. ; Brice, A. ; Payan, C. A. M. ; Saker-Delye, S. ; Dürr, A. ; Wood, N. W. ; Tittmann, L. ; Lieb, W. ; Franke, A. ; Rietschel, M. ; Cichon, S.FZJ* ; Nöthen, M. M. ; Amouyel, P. ; Tzourio, C. ; Dartigues, J.-F. ; Uitterlinden, A. G. ; Rivadeneira, F. ; Estrada, K. ; Hofman, A. ; Curtis, C. ; Blauw, H. M. ; van der Kooi, A. J. ; de Visser, M. ; Goris, A. ; Weber, M. ; Shaw, C. E. ; Smith, B. N. ; Pansarasa, O. ; Cereda, C. ; Del Bo, R. ; Comi, G. P. ; D'Alfonso, S. ; Bertolin, C. ; Sorarù, G. ; Mazzini, L. ; Pensato, V. ; Gellera, C. ; Tiloca, C. ; Ratti, A. ; Calvo, A. ; Moglia, C. ; Brunetti, M. ; Arcuti, S. ; Capozzo, R. ; Zecca, C. ; Lunetta, C. ; Penco, S. ; Riva, N. ; Padovani, A. ; Filosto, M. ; Muller, B. ; Stuit, R. J. ; Blair, I. ; Zhang, K. ; McCann, E. P. ; Fifita, J. A. ; Nicholson, G. A. ; Rowe, D. B. ; Pamphlett, R. ; Kiernan, M. C. ; Grosskreutz, J. ; Witte, O. W. ; Ringer, T. ; Prell, T. ; Stubendorff, B. ; Kurth, I. ; Hübner, C. A. ; Leigh, P. N. ; Casale, F. ; Chio, A. ; Beghi, E. ; Pupillo, E. ; Tortelli, R. ; Logroscino, G. ; Powell, J. ; Ludolph, A. C. ; Weishaupt, J. H. ; Robberecht, W. ; Van Damme, P. ; Franke, L. ; Pers, T. H. ; Brown, R. H. ; Glass, J. D. ; Landers, J. E. ; Hardiman, O. ; Andersen, P. M. ; Corcia, P. ; Vourc'h, P. ; Silani, V. ; Wray, N. R. ; Visscher, P. M. ; de Bakker, P. I. W. ; van Es, M. A. ; Pasterkamp, R. J. ; Lewis, C. M. ; Breen, G. ; Al-Chalabi, A. (Corresponding author) ; van den Berg, L. H. ; Veldink, J. H. (Corresponding author)

2016
Nature America New York, NY

This record in other databases:      

Please use a persistent id in citations: doi:10.1038/ng.3622

Abstract: To elucidate the genetic architecture of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and find associated loci, we assembled a custom imputation reference panel from whole-genome-sequenced patients with ALS and matched controls (n = 1,861). Through imputation and mixed-model association analysis in 12,577 cases and 23,475 controls, combined with 2,579 cases and 2,767 controls in an independent replication cohort, we fine-mapped a new risk locus on chromosome 21 and identified C21orf2 as a gene associated with ALS risk. In addition, we identified MOBP and SCFD1 as new associated risk loci. We established evidence of ALS being a complex genetic trait with a polygenic architecture. Furthermore, we estimated the SNP-based heritability at 8.5%, with a distinct and important role for low-frequency variants (frequency 1-10%). This study motivates the interrogation of larger samples with full genome coverage to identify rare causal variants that underpin ALS risk.

---

Contributing Institute(s):

1. Strukturelle und funktionelle Organisation des Gehirns (INM-1)

Research Program(s):

1. 571 - Connectivity and Activity (POF3-571) (POF3-571)

Appears in the scientific report 2016

---

Database coverage:
; BIOSIS Previews ; Current Contents - Life Sciences ; Ebsco Academic Search ; IF >= 30 ; JCR ; NCBI Molecular Biology Database ; Nationallizenz ; No Authors Fulltext ; SCOPUS ; Science Citation Index ; Science Citation Index Expanded ; Thomson Reuters Master Journal List ; Web of Science Core Collection

---