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DFG project G:(GEPRIS)329460521

Protonentransfer und Substraterkennung in SLC17-Transportern

CoordinatorProfessorin Mercedes Alfonso-Prieto, Ph.D. ; Professor Dr. Paolo Carloni ; Professor Dr. Christoph Fahlke
Grant period2017 - 2023
Funding bodyDeutsche Forschungsgemeinschaft
 DFG
IdentifierG:(GEPRIS)329460521

⇧ FOR 2518: Funktionale Dynamik von Ionenkanälen und Transportern - DynIon - ⇧

Note: Vesikuläre Glutamat-Transporter (VGLUTs) gehören zur SLC17 Familie organischer Anionen-Transporter. Sie akkumulieren Glutamat in synaptischen Vesikeln und stellen damit eine wichtige Determinante der synaptischen Übertragung an exzitatorischen Synapsen dar. Die kürzlich gelöste dreidimensionale Struktur eines homologen bakteriellen D-Galactonat-Transporter (DgoT) war ein wichtiger Schritt für unser Verständnis der Transportmechanismen in dieser Familie. Wir werden eine Kombination aus multiskaligen Molekulardynamiksimulationen, Mutagenese, heterologer Expression, zellulärer Elektrophysiologie und Fluoreszenzspektroskopie benutzen, um Unterschiede in der H+-Kopplung von Galactonat- und Glutamat-Transport und die Mechanismen der Substratselektivität in DgoT und VGLUT zu verstehen. Wir werden mit quantenmechanischen Simulationen, die die in Jülich vorhandene parallele Rechenleistung voll ausschöpfen, die Rolle von Glu133 (konserviert in DgoT und in den VGLUTs) und Asp46 (nur in DgoT vorhanden) für die H+-Kopplung aufklären und die für die Protonenabhängigkeit verantwortlichen Aminosäuren in DgoT und VGLUT identifizieren. Um zu verstehen, wie SLC17 Transporter Substrate unterscheiden, werden wir atomistische Molekulardynamiksimulationen an der oben genannten DgoT-Struktur und an einem experimentell verifizierten VGLUT Homologiemodell und Experimente an beiden Transportern durchführen.
   

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Transport mechanism of DgoT, a bacterial homolog of SLC17 organic anion transporters
Hoboken, NJ [u.a.] : Wiley () DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Light-Activated Agonist-Potentiator of GABA A Receptors for Reversible Neuroinhibition in Wildtype Mice
Journal of the American Chemical Society 146(42), 28822-28831 () [10.1021/jacs.4c08446] OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Transport mechanism of DgoT, a bacterial homolog of SLC17 organic anion transporters
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Calcium-driven In Silico Inactivation of a Human Olfactory Receptor
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Transport mechanisms of DgoT—a bacterial homolog of organic anion transporters
Biophysical journal 123(3), 116a - () [10.1016/j.bpj.2023.11.811]  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Calcium-Driven In Silico Inactivation of a Human Olfactory Receptor
Journal of chemical information and modeling 64(8), 2971–2978 () [10.1021/acs.jcim.4c00249] OpenAccess  Download fulltext Files  Download fulltextFulltext BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Fluoride Transport and Inhibition Across CLC Transporters
Anion Channels and Transporters / Fahlke, Christoph (Editor) ; Cham : Springer International Publishing, 2024, Chapter 593 ; ISSN: 0171-2004=1865-0325 ; ISBN: 978-3-031-51345-9=978-3-031-51346-6 ; doi:10.1007/978-3-031-51346-6 Cham : Springer International Publishing, Handbook of Experimental Pharmacology 283, 81 - 100 () [10.1007/164_2022_593]  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Machine Learning-based Modeling of Olfactory Receptors in their Inactive State: Human OR51E2 as a Case Study
bioRxiv beta () [10.1101/2023.02.22.529484] OpenAccess  Download fulltext Files  Download fulltextFulltext BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Exploring the transport cycle of DgoT, a bacterial homolog of human vesicular glutamate transporters
Biophysical journal 122(3), 231a - () [10.1016/j.bpj.2022.11.1363] OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Fluoride permeation mechanism of the Fluc channel in liposomes revealed by solid-state NMR
Science advances 9(34), eadg9709 () [10.1126/sciadv.adg9709] OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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 Record created 2021-09-20, last modified 2024-09-25
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