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DFG project G:(GEPRIS)291198853

FOR 2518: Funktionale Dynamik von Ionenkanälen und Transportern - DynIon -

CoordinatorProfessor Dr. Klaus Benndorf
Grant period2017 - 2025
Funding bodyDeutsche Forschungsgemeinschaft
 DFG
IdentifierG:(GEPRIS)291198853

Note: Die DFG-Forschergruppeninitiative Funktionale Dynamik von Ionenkanälen und Transportern kombiniert experimentelle und computerbasierte theoretische Ansätze zur Untersuchung von Ionenkanälen und Transportern. Der Fokus wird dabei auf der Aktivierung von Ionenkanälen durch chemische Signale liegen. Einbezogen werden Ionenkanäle, die die Bindung von Liganden für die Kanalöffnung benötigen (ionotrope Glutamatrezeptoren), Ionenkanäle, die durch Liganden moduliert werden (K2P Kanäle, spannungsabhängige K+-Kanäle, durch zyklische Nukleotide modulierte Ionenkanäle) und Transporter, die kanalartige Konformationen einnehmen können (EAAT-Glutamattransporter und CLC-Anionenkanälen/Anion-Proton-Austauscher). Verschiedene experimentelle Methoden aus den Bereichen Elektrophysiologie, Biochemie, Fluorometrie und Strukturbiologie werden mit Computertechniken wie all-atom-Moleküldynamik (MD), hybridquantenmechanische / molekülmechanische Simulationen, freie Energieberechnungen und Markov-Modellierungen kombiniert. Die Strategie der Forschergruppeninitiative wird eine anderweitig nicht erreichbare Synergie zwischen Computersimulationen und Experimenten nutzen und fördern. Wir erwarten, dass das Forschungsprogramm nicht nur neue Einblicke in ausgewählte Ionenkanäle und Transporter liefern, sondern auch theoretische und experimentelle Ansätze in der Ionenkanalforschung vorantreiben wird.
   

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Allosteric modulation of proton binding confers Cl- activation and glutamate selectivity to vesicular glutamate transporters
PLoS Computational Biology 21(6), e1013214 - () [10.1371/journal.pcbi.1013214] OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Calcium-activated chloride channel TMEM16A opens via pi-helical transition in transmembrane segment 4
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122(18), e2421900122 () [10.1073/pnas.2421900122] OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Transport mechanism of DgoT, a bacterial homolog of SLC17 organic anion transporters
Hoboken, NJ [u.a.] : Wiley () DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Light-Activated Agonist-Potentiator of GABA A Receptors for Reversible Neuroinhibition in Wildtype Mice
Journal of the American Chemical Society 146(42), 28822-28831 () [10.1021/jacs.4c08446] OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Transport mechanism of DgoT, a bacterial homolog of SLC17 organic anion transporters
bioRxiv beta () [10.1101/2024.02.07.579339] OpenAccess  Download fulltext Files  Download fulltextFulltext BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;
Calcium-driven In Silico Inactivation of a Human Olfactory Receptor
bioRxiv beta () [10.1101/2024.01.31.578070] OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Transport mechanisms of DgoT—a bacterial homolog of organic anion transporters
Biophysical journal 123(3), 116a - () [10.1016/j.bpj.2023.11.811]  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Calcium-Driven In Silico Inactivation of a Human Olfactory Receptor
Journal of chemical information and modeling 64(8), 2971–2978 () [10.1021/acs.jcim.4c00249] OpenAccess  Download fulltext Files  Download fulltextFulltext BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Fluoride Transport and Inhibition Across CLC Transporters
Anion Channels and Transporters / Fahlke, Christoph (Editor) ; Cham : Springer International Publishing, 2024, Chapter 593 ; ISSN: 0171-2004=1865-0325 ; ISBN: 978-3-031-51345-9=978-3-031-51346-6 ; doi:10.1007/978-3-031-51346-6 Cham : Springer International Publishing, Handbook of Experimental Pharmacology 283, 81 - 100 () [10.1007/164_2022_593]  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Machine Learning-based Modeling of Olfactory Receptors in their Inactive State: Human OR51E2 as a Case Study
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 Datensatz erzeugt am 2023-01-18, letzte Änderung am 2025-01-09
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