Journal Article FZJ-2022-01947

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Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia

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2022
Nature Publ. Group London [u.a.]

Nature <London> 604, 502–508 () [10.1038/s41586-022-04434-5]

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Abstract: Schizophrenia has a heritability of 60–80%1, much of which is attributable to common risk alleles. Here, in a two-stage genome-wide association study of up to 76,755 individuals with schizophrenia and 243,649 control individuals, we report common variant associations at 287 distinct genomic loci. Associations were concentrated in genes that are expressed in excitatory and inhibitory neurons of the central nervous system, but not in other tissues or cell types. Using fine-mapping and functional genomic data, we identify 120 genes (106 protein-coding) that are likely to underpin associations at some of these loci, including 16 genes with credible causal non-synonymous or untranslated region variation. We also implicate fundamental processes related to neuronal function, including synaptic organization, differentiation and transmission. Fine-mapped candidates were enriched for genes associated with rare disruptive coding variants in people with schizophrenia, including the glutamate receptor subunit GRIN2A and transcription factor SP4, and were also enriched for genes implicated by such variants in neurodevelopmental disorders. We identify biological processes relevant to schizophrenia pathophysiology; show convergence of common and rare variant associations in schizophrenia and neurodevelopmental disorders; and provide a resource of prioritized genes and variants to advance mechanistic studies.

Classification:

Contributing Institute(s):
  1. Strukturelle und funktionelle Organisation des Gehirns (INM-1)
Research Program(s):
  1. 5251 - Multilevel Brain Organization and Variability (POF4-525) (POF4-525)

Appears in the scientific report 2022
Database coverage:
Medline ; OpenAccess ; BIOSIS Previews ; Biological Abstracts ; Chemical Reactions ; Clarivate Analytics Master Journal List ; Current Contents - Agriculture, Biology and Environmental Sciences ; Current Contents - Life Sciences ; Current Contents - Physical, Chemical and Earth Sciences ; Ebsco Academic Search ; Essential Science Indicators ; Index Chemicus ; JCR ; SCOPUS ; Science Citation Index Expanded ; Web of Science Core Collection ; Zoological Record
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 Record created 2022-04-20, last modified 2023-05-02


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